Начальник войск – заместители наркома по войскам:
АПОЛЛОНОВ Аркадий Николаевич (с 11 марта 1942 г.), генерал-майор, с 20 декабря 1942 г. – генерал-лейтенант [1];

А.Н.Аполлонов

Штаб

Политическое управление:

При образовании объединенного НКВД в июле 1941 г. в его состав вошли:

• Оперативные войска
• Пограничные войска
• Войска НКВД по охране тыла Действующей Красной Армии (в подчинении начальника пограничных войск)

• Внутренние войска (в составе конвойных частей, частей по охране особо важных предприятий промышленности и железных дорог)

Приказом НКВД №00150 от 19 января 1942 г. была проведена реформа системы войск НКВД. На базе внутренних войск были созданы:

• Войска НКВД по охране особо важных предприятий промышленности
• Войска НКВД по охране железных дорог
• Конвойные войска НКВД

Оперативные войска НКВД были переименованы во внутренние. Руководство каждым из родов войск осуществляло соответствующее Управление.

Приказом НКВД №00852 от 28 апреля 1942 г. войска НКВД по охране тыла Действующей Красной Армии были переданы в подчинение начальника внутренних войск НКВД, при этом Управление внутренних войск было преобразовано в Главное управление.

Подразделения обеспечения:

• Управление военного снабжения;
• Военно-строительный отдел;
• Мобилизационный отдел;
• Финансовый отдел войск НКВД;

В дальнейшем происходили следующие изменения:

• 19 ноября 1941 г. Мобилизационный отдел был расформирован;
• 3 марта 1942 г. был создан Отдел военно-учебных заведений войск НКВД;
• 14 ноября 1942 г. Военно-строительный отдел был расформирован с передачей функций в ГУПВ;

[1] С июля 1941 г. был и.о. начальника войск.