Главкомат войск направления создан в октябре 1984 г. со штабом в Кишиневе. Ему подчинялись КВО, ОдВО, ЮГВ, Черноморский флот и 24-я воздушная армия РВГК.

Начальники:
1. ИВАНОВ Михаил Николаевич (11 октября 1984 – 10 февраля 1988 г.), генерал-майор, с 1986 г. – генерал-лейтенант;
2. ДАНЬКО Александр Егорович (1988 – 1990 г.), генерал-майор;
3. ЧИКУЛАЕВ Ефим Гордеевич (1990 – 1991 г.), генерал-майор;

М.Н.Иванов	А.Е.Данько	Е.Г.Чикулаев

Заместители начальника:
ГНЕЗДИЛОВ Николай Иванович (28 января 1985 – 27 марта 1991 г.), генерал-майор;

Н.И.Гнездилов

Особые отделы объединений направления:

• ОО КГБ по ЮГВ
• ОО КГБ по Киевскому ВО
• ОО КГБ по Одесскому ВО
• ОО КГБ по Черноморскому флоту
• ОО КГБ по 24-й ВА РВГК